本作主角是CIA干员威廉卡特（William Carter），他是一名典型的60年代硬汉，拥有奋不顾身的勇气与处变不惊的冷静头脑，还带有一点冷面笑匠的感觉。他的身手高明到连当时的CIA局长胡佛都亲自指派特别任务给他，但也因为长期在外出勤，让他遭遇了一件悲剧而无法挽救：家人因火灾全部死于家中。从此之后卡特心中便蒙上一层阴影，而且只执行美国本地的任务，于是意志消沉的他被调到军方机密设施「Groom Range」出闲差，而设施局长Myron Faulke则要求他保护一只重要的箱子。

这位带着复古帽子的就是主角卡特！

　　有一天，一位女性军官来到卡特的办公室，说有命令请她来接收那只箱子，但老江湖的卡特当然不肯交出来，没想到女军官瞬间变脸，原来她早就被外星人给洗脑了。一阵扭打之后，卡特虽然成功击杀女军官，但箱子不但被毁掉，「Groom Range」也被外星人突袭而陷入混乱。这时卡特想到的第一件事，就是确保Faulke局长的安全，于是他开始与幸存的干员会合一起突围，寻找Faulke的下落。

我...美...吗？

　　游戏一开始以剧情的方式给予玩家教学，卡特一开始是孤军奋战，不过之后会与其他干员会合。在会合之前，玩家可以先熟悉卡特本人的操控方式。其实就跟大多数的TPS一样，如果玩家之前有玩过《战争机器》之类的游戏，那应该很快就能上手了。

看到掩体就躲是常识。

按方向键的右箭头就会显示任务目的地，让玩家不会迷路。

按LT举枪，RT射击。

随处逛逛，有时会翻到一些文件与照片。

而且还会捡到枪。这把M14在游戏序盘非常重要。不觉得介面这很像卡片游戏或桌游吗？

　　与幸存干员会合后，卡特就能够指挥队员作战了。指挥系统是一个名叫「战斗聚焦（Battle Focus）」的指令环，按B键开启之后，用左类比摇杆选择命令，再按A钮就能下达命令。只要技能处于准备好的状态，玩家就可以一次下达数个命令，如果想让卡特自己行动，就再按一次B键关闭战斗聚焦。这样讲感觉有点手忙脚乱，因为要同时操控卡特跟下命令，但在开启战斗聚焦时，时间的流动会变得非常慢，让玩家可以仔细思考战术，所以倒不必担心游戏难度太高。 （而且游戏也有提供简单难度可以选择）附带一提的是，玩家在序章遇到的两个干员都是开外挂的等级，所以可以用一些高阶技能，我想这样设计大概是避免玩家一开始就信心受挫吧。

第一次指挥之前会有简易的幻灯片教学。

自己留在原地吸引枪塔注意，然后派队员绕到旁边攻击。

实际做一次。对Nils下达「移动（Move）」命令。

让干员移动到有掩体保护的地方。蓝色盾形记号表示这位置不会被直接射击。

错误示范。红色盾形记号表示会遭受攻击，枪塔的红色箭头都指过来了。

接者再下达另一个命令。

　　Nils身为「侦查兵（Recon）」，可以使用强力的「致命射击（Critical Strike）」。

瞄准枪塔！

看到那个蓝色家伙了吗？他就是Nils，精准地射中枪塔！

连外星人都不禁为卡特的英明指挥而手舞足蹈（误）

玩家也可以向干员下达「Mark Target（标记目标）」命令，这样可以让干员优先攻击该敌人。

　　像这只外星人被我方绕到侧翼，干员的攻击效率是375%，白话文是「闭眼都能打中」。

曝露身体的外星人，血条下方会出现「Exposed」字样，请不要客气，放倒它吧。

这玩意儿会一直生敌人出来，请优先击破它。

请工程师干员架枪塔。 （这是高阶技能）

其实架好之后敌人也死光了..

　　历经一番波折，卡特终于找到Faulke。 Faulke打算撤离这里，并且请卡特等人利用铁路逃离主设施，然后利用外围的自爆装置将「Groom Range」整个炸毁，而Faulke已经安排好军事运输机，准备把完成任务的卡特等人撤到「某机密单位」。这段剧情中卡特会有出现两个对话选择，前者似乎会影响后续的剧情发展，后者则是单纯对剧情资讯的补述。往后卡特还会遇到许多这样的对话选择。

我做人比较诚实，直接承认箱子被毁了...

有问题就尽量问吧。放左边的选项则是结束对话用的。

　　在卡特等人的奋战之下，大家终于成功撤离，序章的任务也结束了。每次任务结束后都会出现结算画面，让玩家可以回顾剧情、看看杀了多少外星鬼子、捡了多少枪枝装备、以及探员的成长状况。

啊...我的iPad忘了拿...

在等运输机来之前，还得迎战一缸子的外星人。

快逃啊～

血染东方一片红...

忘记剧情？有剧情大纲给你慢慢看。

捡到​​的武器与装备，下次出任务前就可以先装在身上了！

　　来到「机密单位」的卡特，在Faulke的解说下才知道这个机密单位就是对付苏联的「The Bureau（调查局）」，原本成员只有少数菁英，但在外星人大举入侵之下，「调查局」立刻用早就准备好的「口袋名单」从各界征募人才，卡特就是其中一员（而且还是CIA局长胡佛亲自推荐！）。而从此之后，「调查局」直接改组成「XCOM」，成为对抗外星人的终极防线。

一看就知道不单纯的组织...

XCOM迷听到这句话应该会心头一震吧！

趁机偷看一下卡特的档案。

　　这时卡特终于可以自己挑选干员与任务了。玩家可以挑选最多两个干员同行，队员共有「突击兵」、「侦查兵」、「支援兵」、「工程师」四种兵科，每种兵科能装备的武器与技能都不同。卡特与干员都会随着任务执行而升级，不但体力值会上升，还能学会更强力的技能。所以与其说《调查局：幽浮解密》是TPS，还不如说它是包了TPS外皮的RPG。另外要特别注意的一点，是干员一旦在任务中死亡就无法复活了，而且如果卡特旗下的干员如果全死光，游戏就会直接结束！如何？不敢派部属去送死了吧？

支援兵（Support）：初期技能是强化特定范围内我方成员的攻击力。

侦查兵（Recon）：初期技能是强悍的致命射击。

工程师（Engineer）：初期技能是让一定范围内的敌人陷入混乱。

突击兵（Commando）：初期血比别人多一格，技能是挑衅外星人吸引注意力。

我们的主角卡特！只有他可以装备两把枪与副武器！

每个职业能装备的枪都不一样。选择最顺手的枪吧。

每升一级就能学到一个固有技能，还有一个自选技能。

　　技能分为在战斗中以命令执行的主动技，以及直接对干员产生效果的辅助技等等。例如卡特在第2级学会的「浮空（Lift）」就是主动技。

学会新的主动技还会有超贴心幻灯片教学。

　　浮空敌人可以让敌人毫无防备，在空中当靶被打成蜂窝。

侦查兵在第2级会有两个自选辅助技能，只能选择一个。

左边是减少被敌人击中的机率，右边是增加狙击枪的攻击力。我比较胆小所以选左边。

　　接下来小编我选择让卡特继续执行主线任务。第二个主线任务中，一所大学被外星人破坏，卡特必须救出该大学的某位科学家。这个任务就是之前在试玩会给大家玩的任务，以下小编我介绍几个难缠的敌人与实用的技能，让大家体会一下《调查局：幽浮解密》的战斗风貌。

任务选择画面，先冲主线！

人都死得差不多了...

来，有几根手指头？

卡特倒地的话，就要选择「复苏（Revive）」让其他干员来拯救，否则就会阵亡。

　　当然伙伴倒地卡特也要去救啰。

卡特的专有技能「治疗（Heal）」可以恢复全体成员的体力值。

　　所有技能使用后都要等待一段时间才能再使用。

出现圣光！

让工程师放个混乱吧。

工程师升到第2级之后还可以设置地雷，但是我到现在还没有成功炸过人。

升级了！赶快按Back键学技能！

接着卡特就能浮空敌人了！

头目级敌人登场！

这家伙胸部有装甲（血条右边有显示），看玩家是要打其他地方还是先把装甲打爆。

捡到​​外星人的枪了！这把扩散雷射枪火力比地球人的武器强多了！

还捡到「神枪手背包」，可以让所有武器的头部射击损伤增加。

这个大箱子就跟《生化危机》的箱子一样，可以让干员自由换装。

赶紧把刚刚拿到的神兵装在干员身上吧。

　　附带一提，这把雷射枪除了卡特之外只有工程师能装备。

敌人的兵器可说是千奇百怪，但只靠三个地球人就能战胜的玩家更厉害！